2016年度に保険医療機関（医科）に対して実施された指導・監査は以下の通りだった。
特徴として、適時調査の大幅な増加が見られ、2012年（2,217件）と比較すると1.5倍増になっている。
一方で監査は、減少傾向にあり、2012年（53件）からほぼ半減している。

1. 個別指導：1,601件(＋35件)
2. 新規個別指導：2,154件(△16件)
3. 集団的個別指導：4,630件（＋325件）
4. 適時調査：3,356件(＋795件)
5. 監査：28件(△9件）

※カッコ内は対前年度比

『平成28年度における保険医療機関等の指導・監査等の実施状況について』（厚生労働省）より